畜禽养殖业规模化、集约化的发展造成大量粪便的堆积，这不仅影响周边居民的日常生活，而且造成严重的环境污染问题，使用好氧堆肥技术处理粪便是个很好的解决途径。畜禽粪便本身是优质有机肥的原料，其中含有大量的纤维，为微生物的生存提供足够的养料，而且具有改良土壤结构的作用，但粪污生产有机肥必须进行好氧发酵，这样能去除畜禽粪便的臭味，使其不稳定的有机肥原料逐渐降解为真正的有机肥。

有机肥厂常用的翻堆设备主要包括槽式翻堆机和条垛式翻堆机，简单地说也就是前者需要砌发酵槽，后者无需砌槽。前者常用的翻堆机按原理包括粑齿式翻堆机、链板式翻堆机和双螺旋式翻堆机等等；后者主要包括履带式翻堆和轮式翻堆机。

对应着上述两类翻堆机，目前使用较为广泛的有机肥堆肥工艺分为两种，一是槽式翻堆机堆肥工艺；二是条垛式发酵工艺。

槽式翻堆工艺原理为：先将畜禽粪便预处理，将垫料如锯末、稻壳、菌种与其充分混合，然后在发酵槽中通过槽式翻堆机来回翻堆搅拌，使其中的水分得以蒸发，一般情况下堆肥20d就能完全腐熟。

猪粪堆包发酵工艺：将猪舍猪粪进行固液分离后，粪渣、干清粪及菌种进行混合，一般固液分离机分离后的粪渣含水量在50%到60%，然后将混合物料用装载机堆放成条垛状，翻堆时用履带式翻堆机骑跨在料垛上进行翻堆。

槽式翻堆机堆肥的优势在于，在工作运行时翻抛动力比较足，翻堆更加彻底，避免由于翻堆不及时造成的厌氧发酵，同时在发酵车间具有极好的升温保温功能，缺点是投资成本高，额外增加了土建成本。

条垛式发酵优势在于投资小，运营成本低，堆肥的质量较高，主要用于中小型的商品有机肥的生产和养猪场的粪便无害化的处理。但是缺点是占用空间大，人工成本高。