在堆肥过程中，随着物料中微生物活动的加剧，微生物分解有机物所释放出的热量大于堆肥的热耗时，堆肥温度就上升。因此温度是判断微生物活动剧烈程度的最好参数。

畜禽粪便堆肥发酵设备

温度的作用主要是影响微生物的生长，一般认为高温菌对有机物的降解效率高于中温菌，当今的快速、高温好氧堆肥正利用这一特点，在堆肥的初期，堆体温度一般与环境温度相近，经过中温菌1~2d的作用，堆肥温度便能达到高温菌的理想温度50~65℃，按此温度，一般堆肥5~6d,即可完成无害化过程。因此，在堆肥过程中，堆体温度应控制在50~65℃之间，但在55~65℃时比较好，不易超过60℃。温度超过60℃，微生物的生长活动即开始受到抑制。温度过高会过度消耗有机质，并降低堆肥产品质量。为达到杀灭病原菌的效果，对于装置式系统（反应器系统）和静态通风垛系统，堆体内部温度大于55℃的时间必须3d。对于条垛式系统，堆体内部温度大于55℃的时间至少为15d,且在操作过程中至少达3d。对于条垛式系统，堆体内部温度大于55℃的时间至少为15d,且在操作过程中至少翻堆5次。

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根据绘制的常规堆肥温度变化曲线，可判断发酵过程的进展情况。如测出温度偏离常规温度曲线，就表明微生物的活动受到了某种因素的干扰或阻碍，而常规的影响因素主要是供氧情况和垃圾含水量。一般地，在堆肥初期的3~5d中，通风的主要目的是满足供氧，使生化反应顺利进行，已达到提高堆体温度的目的。当堆肥温度升到80~90℃，这将严重影响微生物的生长繁殖，因此必须通过加大通风量将堆体内的水分和热量带走，使堆温下降。

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在生产实际中，往往通过温度-供气反馈系统来完成温度的自动控制，通过在堆体中安装温度反馈系统，当堆体内部温度超过60℃时，风机自动开始向堆体内送风，从而排出堆料中的热量和水汽，使堆体温度降下来。而对于无通气系统的条垛式堆肥，则采用定期翻堆来实现通风控温。若运行正常，而堆温却持续下降，即可判定堆肥已进入结束前的降温阶段。